倪应眷（字申之，号吉旋），明朝政治人物，明南直隶桐城人。1607年（万历三十五年）考中进士，先后担任上杭县知县和福建省道御史。在朱由校时期，晋升为太仆寺少卿。崇祯初年，倪应眷先后担任南太仆正卿、长芦巡盐御史等职。因逆魏忠贤，被削去官职，最后以八十岁高龄在乡里去世。
倪应眷曾授上杭知县，再升任御史。熹宗时晋太仆少卿。崇祯初，累迁南太仆正卿。年八十卒于乡里。