微卫星标记(microsatellite),也称作短串联重复序列(short tandem repeats, STRs)或简单重复序列(simple sequence repeats),是指分布在真核生物基因组中的简单重复序列。这些序列由2至6个核苷酸的串联重复片段构成,因重复单位的重复次数在个体间呈现高度变异性和丰富的数量而具有广泛应用价值。

特征

微卫星标记的特点包括操作简便,只需少量组织样本即可进行脱氧核糖核酸降解分析。其标记带型简单明了,PCR技术的使用使得微卫星标记技术实现了自动化操作。此外,微卫星标记在亲缘关系相近的物种间具有较高的保守性,重复单位和重复次数在相关物种中表现出一定的一致性。微卫星标记的突变率较高,每代每个配子的每个位点约有25×10^-5至1×10^-2的突变概率,这导致了微卫星的数量差异。微卫星通常是复等位的,代表着每个微卫星位点的等位基因数目高度可变。微卫星DNA的多态性高于其他标记技术,如限制性片段长度多态性(RFLP)、随机扩增多态性DNA(RAPD)。微卫星标记呈共显性的格雷戈尔·孟德尔式遗传,能有效鉴别杂合体,且不受环境和其他因素的影响,表现中性。

分类

微卫星标记可分为三类:单纯(SSR)、复合(SSR)和间隔(SSR)。单纯SSR由单一重复单元组成,如(AT)n;复合SSR则由两个或更多重复单元组成,如(GT)n(AT)m;间隔SSR在重复序列中包含其他核苷酸,如(GT)nGG(GT)m。

应用

微卫星标记在遗传学领域有着广泛的应用,特别是在遗传杂交育种和绘制染色体遗传图谱方面。同时,高度多态的微卫星标记也被用于人群中个体的识别。

参考资料

微卫星标记分析.微卫星标记分析.2024-10-23

微卫星标记.原创力文档.2024-10-23

微卫星标记.道客巴巴.2024-10-23